Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms