Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA5Q6Q788 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms