Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC174Q6PII3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms