Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRT80Q6KB66 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms