Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSAPQ6IQ19 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms