Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms