Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF123Q5XPI4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms