Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHEQ5VZ18 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms