Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC1Q5VXU3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms