Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms