Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms