Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms