Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms