Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms