Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms