Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AMER1Q5JTC6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMER1Q5JTC6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms