Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms