Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBK1Q52WX2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK1Q52WX2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms