Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRNQ4KMQ1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms