Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIK1Q3SY52 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIK1Q3SY52 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms