Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LSM12Q3MHD2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSM12Q3MHD2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LSM12Q3MHD2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms