Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms