Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms