Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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