Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms