Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN1Q16658 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms