Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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CTF1Q16619 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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CTF1Q16619 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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CTF1Q16619 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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