Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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DDB1Q16531 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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DDB1Q16531 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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DDB1Q16531 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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DDB1Q16531 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
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DDB1Q16531 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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