Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA4Q16363 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA4Q16363 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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