Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms