Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC85BQ15834 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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