Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP1Q15431 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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