Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN1Q15223 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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