Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 IL17RC-230ENST00000498214 2346 ntTSL 221.2■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-225ENST00000483582 2467 ntTSL 1 (best)20.76■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-227ENST00000494365 2499 ntTSL 220.32■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-210ENST00000438091 1208 ntTSL 519.55■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-209ENST00000436503 1445 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-219ENST00000466046 2547 ntTSL 218.65■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-204ENST00000412901 1354 ntTSL 218.21■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 GPS2-204ENST00000571098 1045 ntTSL 219.65■□□□□ 0.743e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 GPS2-211ENST00000573059 829 ntTSL 314.77□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 GPS2-209ENST00000572363 1143 ntTSL 514.11□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 GPS2-216ENST00000577040 916 ntTSL 513.62□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 ATP5B-206ENST00000550162 863 ntTSL 212.82□□□□□ -0.362e-26■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 HDAC3-206ENST00000471968 529 ntTSL 35.65□□□□□ -1.52e-17■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 POLRMT-207ENST00000592633 469 ntTSL 214.47□□□□□ -0.097e-9■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 DPAGT1-218ENST00000640102 1195 ntTSL 512.39□□□□□ -0.437e-10■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 212.12□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 511.27□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-207ENST00000517518 1597 ntTSL 1 (best)10.64□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 SLC47A1-213ENST00000581558 414 ntTSL 35.25□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 NDRG2-217ENST00000553567 555 ntTSL 416.7■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 NDRG2-269ENST00000557305 603 ntTSL 29.21□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 NDRG2-205ENST00000366204 572 ntTSL 46.23□□□□□ -1.411e-8■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 PLEKHG2-214ENST00000596443 527 ntTSL 39.23□□□□□ -0.937e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 PLEKHG2-211ENST00000594307 198 ntTSL 38.58□□□□□ -1.047e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 NELFCD-212ENST00000497935 666 ntTSL 26.51□□□□□ -1.375e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.922e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 PNN-203ENST00000554117 624 ntTSL 210.08□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 USP19-214ENST00000488993 1116 ntTSL 521.19■□□□□ 0.982e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 USP19-215ENST00000491859 919 ntTSL 317.75■□□□□ 0.432e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 USP19-212ENST00000480163 397 ntTSL 314.41□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 KATNB1-206ENST00000566611 3854 ntTSL 215.96■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 212.33□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 PIM3-202ENST00000467480 723 ntTSL 229.59■■■□□ 2.331e-21■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 317.29■□□□□ 0.362e-22■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 RBM3-204ENST00000466764 1375 ntTSL 316.38■□□□□ 0.216e-14■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.066e-14■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 RBM3-208ENST00000489344 724 ntTSL 213□□□□□ -0.336e-14■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.456e-14■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 519.19■□□□□ 0.663e-12■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 418.24■□□□□ 0.513e-12■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 517.15■□□□□ 0.343e-12■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 INTS11-206ENST00000430786 849 ntTSL 513.77□□□□□ -0.213e-12■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 INTS11-229ENST00000526113 591 ntTSL 513.39□□□□□ -0.273e-12■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 INTS11-231ENST00000526797 659 ntTSL 411.18□□□□□ -0.623e-12■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)23.38■■□□□ 1.331e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 222.87■■□□□ 1.251e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.791e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.651e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-206ENST00000472277 536 ntTSL 317.94■□□□□ 0.461e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-209ENST00000496131 962 ntTSL 313.49□□□□□ -0.251e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 EI24-208ENST00000529812 493 ntTSL 423.84■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.012e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-9■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.922e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 NDUFA11-203ENST00000591160 604 ntTSL 319.13■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 MRPL4-210ENST00000592071 1487 ntTSL 318.52■□□□□ 0.565e-15■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-215ENST00000528173 5737 ntTSL 515.92■□□□□ 0.142e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 SPG7-210ENST00000564409 717 ntTSL 314.03□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-208ENST00000524984 3512 ntTSL 213.98□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-219ENST00000531879 2922 ntTSL 213.7□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 37.65□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.861e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 PRRC2A-207ENST00000469501 347 ntTSL 59.18□□□□□ -0.942e-11■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 IRAK1-207ENST00000443220 1175 ntTSL 213.86□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 38.4
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