Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME4Q14997 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME4Q14997 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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