Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms