Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC1AQ14683 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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