Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms