Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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