Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL4Q14135 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms