Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPSQ13938 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPSQ13938 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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