Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NCOA4Q13772 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCOA4Q13772 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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