Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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