Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
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