Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD1Q13562 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD1Q13562 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
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