Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SP140Q13342 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SP140Q13342 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SP140Q13342 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SP140Q13342 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SP140Q13342 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SP140Q13342 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SP140Q13342 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SP140Q13342 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SP140Q13342 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SP140Q13342 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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