Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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SKP2Q13309 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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