Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF5Q13243 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms