Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
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