Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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TRAF3Q13114 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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